Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tcirg1Q9JHF5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tcirg1Q9JHF5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tcirg1Q9JHF5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcirg1Q9JHF5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms