Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET77

Jph3, Junctophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph3Q9ET77 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Jph3Q9ET77 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Jph3Q9ET77 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Jph3Q9ET77 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Jph3Q9ET77 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Jph3Q9ET77 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Jph3Q9ET77 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Jph3Q9ET77 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms