Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tm9sf3Q9ET30 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tm9sf3Q9ET30 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tm9sf3Q9ET30 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tm9sf3Q9ET30 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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