Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.23■■■■■ 4.35
Rb1cc1Q9ESK9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Rb1cc1Q9ESK9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Rb1cc1Q9ESK9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
Rb1cc1Q9ESK9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Rb1cc1Q9ESK9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Rb1cc1Q9ESK9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Rb1cc1Q9ESK9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC42.19■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.15■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
Rb1cc1Q9ESK9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC42.12■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC42.07■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Rb1cc1Q9ESK9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Rb1cc1Q9ESK9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Rb1cc1Q9ESK9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Rb1cc1Q9ESK9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.98■■■■■ 4.31
Rb1cc1Q9ESK9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Rb1cc1Q9ESK9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Rb1cc1Q9ESK9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Rb1cc1Q9ESK9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Rb1cc1Q9ESK9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.3
Rb1cc1Q9ESK9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC41.87■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC41.84■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Rb1cc1Q9ESK9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms