Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ropn1Q9ESG2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ropn1Q9ESG2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ropn1Q9ESG2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ropn1Q9ESG2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ropn1Q9ESG2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ropn1Q9ESG2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ropn1Q9ESG2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ropn1Q9ESG2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ropn1Q9ESG2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ropn1Q9ESG2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ropn1Q9ESG2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms