Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ms4a4bQ9ES61 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ms4a4bQ9ES61 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ms4a4bQ9ES61 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms