Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc28a3Q9ERH8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc28a3Q9ERH8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc28a3Q9ERH8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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