Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cxcr6Q9EQ16 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cxcr6Q9EQ16 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxcr6Q9EQ16 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms