Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ropn1lQ9EQ00 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ropn1lQ9EQ00 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ropn1lQ9EQ00 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms