Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabarapQ9DCD6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabarapQ9DCD6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GabarapQ9DCD6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabarapQ9DCD6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GabarapQ9DCD6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GabarapQ9DCD6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabarapQ9DCD6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GabarapQ9DCD6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
GabarapQ9DCD6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GabarapQ9DCD6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GabarapQ9DCD6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GabarapQ9DCD6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GabarapQ9DCD6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GabarapQ9DCD6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms