Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpne8Q9DC53 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpne8Q9DC53 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpne8Q9DC53 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cpne8Q9DC53 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms