Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Swt1Q9DBQ9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Swt1Q9DBQ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Swt1Q9DBQ9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Swt1Q9DBQ9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Swt1Q9DBQ9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms