Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW9

Cnn3, Calponin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn3Q9DAW9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnn3Q9DAW9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnn3Q9DAW9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cnn3Q9DAW9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cnn3Q9DAW9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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