Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhobtb1Q9DAK3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rhobtb1Q9DAK3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rhobtb1Q9DAK3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhobtb1Q9DAK3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 257.6 ms