Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK2

Pacrg, Parkin coregulated gene protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PacrgQ9DAK2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
PacrgQ9DAK2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PacrgQ9DAK2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PacrgQ9DAK2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms