Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H5

1700069L16Rik, RIKEN cDNA 1700069L16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700069L16RikQ9D9H5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700069L16RikQ9D9H5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700069L16RikQ9D9H5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700069L16RikQ9D9H5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700069L16RikQ9D9H5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700069L16RikQ9D9H5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700069L16RikQ9D9H5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700069L16RikQ9D9H5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700069L16RikQ9D9H5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700069L16RikQ9D9H5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700069L16RikQ9D9H5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700069L16RikQ9D9H5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700069L16RikQ9D9H5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700069L16RikQ9D9H5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
1700069L16RikQ9D9H5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700069L16RikQ9D9H5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700069L16RikQ9D9H5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700069L16RikQ9D9H5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms