Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tmco5aQ9D9D5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tmco5aQ9D9D5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmco5aQ9D9D5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmco5aQ9D9D5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmco5aQ9D9D5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms