Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c6Q9D8P7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c6Q9D8P7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Gtf3c6Q9D8P7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gtf3c6Q9D8P7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms