Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Derl3Q9D8K3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Derl3Q9D8K3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Derl3Q9D8K3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms