Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn23Q9D7D7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cldn23Q9D7D7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn23Q9D7D7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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