Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Krt34Q9D646 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Krt34Q9D646 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Krt34Q9D646 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt34Q9D646 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt34Q9D646 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms