Protein–RNA interactions for Protein: Q9D542

4930470P17Rik, RIKEN cDNA 4930470P17, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930470P17RikQ9D542 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930470P17RikQ9D542 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930470P17RikQ9D542 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
4930470P17RikQ9D542 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms