Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrameQ9D4Z5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrameQ9D4Z5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrameQ9D4Z5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms