Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930556J24RikQ9D4U7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
4930556J24RikQ9D4U7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms