Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc6Q9D4E6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pabpc6Q9D4E6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pabpc6Q9D4E6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pabpc6Q9D4E6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pabpc6Q9D4E6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms