Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
4930548H24RikQ9D496 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4930548H24RikQ9D496 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
4930548H24RikQ9D496 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4930548H24RikQ9D496 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms