Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syce1Q9D495 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Syce1Q9D495 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syce1Q9D495 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms