Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
4933425L06RikQ9D3Z8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms