Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tchhl1Q9D3P1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tchhl1Q9D3P1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms