Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rufy3Q9D394 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rufy3Q9D394 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rufy3Q9D394 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rufy3Q9D394 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms