Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmed11Q9D2R4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmed11Q9D2R4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmed11Q9D2R4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmed11Q9D2R4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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