Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C2

Cby1, Protein chibby homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cby1Q9D1C2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cby1Q9D1C2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cby1Q9D1C2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cby1Q9D1C2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cby1Q9D1C2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms