Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Syf2Q9D198 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Syf2Q9D198 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Syf2Q9D198 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Syf2Q9D198 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms