Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F3

Lman1, Protein ERGIC-53, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lman1Q9D0F3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lman1Q9D0F3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lman1Q9D0F3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lman1Q9D0F3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lman1Q9D0F3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lman1Q9D0F3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lman1Q9D0F3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lman1Q9D0F3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lman1Q9D0F3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lman1Q9D0F3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lman1Q9D0F3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lman1Q9D0F3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lman1Q9D0F3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lman1Q9D0F3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lman1Q9D0F3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lman1Q9D0F3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms