Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc47Q9D024 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc47Q9D024 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms