Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9CYI0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9CYI0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Q9CYI0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9CYI0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9CYI0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9CYI0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Q9CYI0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CYI0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9CYI0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9CYI0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9CYI0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms