Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Mis12Q9CY25 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mis12Q9CY25 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Mis12Q9CY25 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mis12Q9CY25 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms