Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snx7Q9CY18 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snx7Q9CY18 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snx7Q9CY18 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snx7Q9CY18 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms