Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY16

Mrps28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, mousemouse

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Length 186 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps28Q9CY16 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrps28Q9CY16 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrps28Q9CY16 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrps28Q9CY16 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrps28Q9CY16 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrps28Q9CY16 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mrps28Q9CY16 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrps28Q9CY16 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrps28Q9CY16 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrps28Q9CY16 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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