Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rpl11Q9CXW4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rpl11Q9CXW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms