Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF7

Chd1l, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1lQ9CXF7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Chd1lQ9CXF7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Chd1lQ9CXF7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,29■■□□□ 1,64
Chd1lQ9CXF7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Chd1lQ9CXF7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Chd1lQ9CXF7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Chd1lQ9CXF7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Chd1lQ9CXF7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Chd1lQ9CXF7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Chd1lQ9CXF7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,63
Chd1lQ9CXF7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,16■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25,15■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Chd1lQ9CXF7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,14■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Chd1lQ9CXF7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,04■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Chd1lQ9CXF7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
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