Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX63

Uncharacterized protein C17orf99 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CX63 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CX63 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CX63 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CX63 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CX63 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CX63 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CX63 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CX63 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CX63 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CX63 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CX63 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CX63 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CX63 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CX63 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CX63 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CX63 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CX63 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CX63 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CX63 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CX63 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CX63 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CX63 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CX63 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CX63 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CX63 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CX63 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CX63 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CX63 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CX63 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CX63 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CX63 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CX63 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CX63 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CX63 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CX63 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CX63 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CX63 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CX63 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CX63 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CX63 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CX63 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CX63 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CX63 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CX63 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CX63 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CX63 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CX63 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CX63 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CX63 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CX63 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CX63 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CX63 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CX63 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CX63 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CX63 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CX63 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CX63 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CX63 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CX63 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CX63 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CX63 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CX63 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CX63 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CX63 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CX63 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CX63 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CX63 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CX63 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9CX63 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CX63 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9CX63 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CX63 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CX63 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CX63 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CX63 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CX63 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CX63 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CX63 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CX63 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CX63 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CX63 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CX63 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CX63 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CX63 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CX63 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CX63 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CX63 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CX63 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CX63 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CX63 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CX63 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CX63 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CX63 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CX63 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CX63 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CX63 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CX63 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CX63 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CX63 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CX63 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms