Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RpainQ9CWY9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RpainQ9CWY9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RpainQ9CWY9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
RpainQ9CWY9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RpainQ9CWY9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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