Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cxxc1Q9CWW7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cxxc1Q9CWW7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cxxc1Q9CWW7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cxxc1Q9CWW7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms