Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Snx10Q9CWT3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Snx10Q9CWT3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Snx10Q9CWT3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms