Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

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Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smurf1Q9CUN6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Smurf1Q9CUN6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smurf1Q9CUN6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smurf1Q9CUN6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms