Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp13a2Q9CTG6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atp13a2Q9CTG6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp13a2Q9CTG6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp13a2Q9CTG6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms