Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Klhl28Q9CR40 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Klhl28Q9CR40 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Klhl28Q9CR40 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms