Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tm4sf20Q9CQY8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tm4sf20Q9CQY8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm4sf20Q9CQY8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms