Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX6

Gm16286, MCG141091, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16286Q9CQX6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16286Q9CQX6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm16286Q9CQX6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gm16286Q9CQX6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gm16286Q9CQX6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms